Μικρή χαρακτηρίζεται η ανταπόκριση των επιχειρήσεων για ένταξη στο νέο καθεστώς απόδοσης ΦΠΑ, αφού όπως φαίνεται υπάρχουν πολλά αντικίνητρα για την ένταξη τους με μεγαλύτερο υτό της αύξησης του λογιστικού κόστους.
Όπως σημειώνουν λογιστές και φοροτεχνικοί, τα μηχανογραφικά συστήματα των επιχειρήσεων είναι προσαρμοσμένα σε σύστημα εισπράξεων και για να αλλάξουν σε σύστημα τζίρου- όπως ουσιαστικά απαιτεί το νέο πλαίσιο απόδοσης ΦΠΑ- απαιτείται μεγάλο κόστος, που φτάνει ή ξεπερνά τις 20.000 ευρώ. Αυτό, όμως, δεν είναι το μοναδικό αντικίνητρο, αφού οι επιταγές ως μέσο πληρωμών δεν αντιμετωπίζονται σύμφωνα με αυτό που ισχύει πραγματικά στην αγορά.
Έτσι, η ΓΓΔΕ θεωρεί ότι η επιταγή πληρώνεται όταν παραδίδεται στον επιτηδευματία, ακόμα κι όταν είναι μεταχρονολογημένη, κάτι που σημαίνει πρακτικά ότι πρέπει να αποδίδεται άμεσα ο ΦΠΑ ενώ η επιταγή θα πληρωθεί μετά από μήνες.